英国のフランシスクリック研究所とシャリテー – ベルリン医科大学の研究者、および他機関の同僚は、 COVID-19 の患者が重症になる可能性が高いかどうかの予測に使用できる27のタンパク質バイオマーカーを特定した。COVID-19を引き起こすRNAウイルスであるSARS-CoV-2に感染した人々は、異なる反応を示す。 この病気は症状が出ない人もいれば、入院が必要な致命的な人もいる。この研究では、2020年6月1日にCell Systems誌でオンラインで公開され、COVID-19患者のさまざまな症状の重症度に応じた、27のバイオマーカー候補を発見したことが発表された。このバイオマーカーは、医師が患者の病気を予測し、科学者に医薬品開発の新しいターゲットを提供するのに役立つ。 このオープンアクセスCell Systemsの論文は「超ハイスループットの臨床プロテオミクスがCOVID-19感染の分類子を明らかにする（Ultra-High-Throughput Clinical Proteomics Reveals Classifiers of COVID-19 Infection.）」と題されている。
研究者らは、血漿中のさまざまなタンパク質の存在と量を迅速にテストするために、質量分析（MS）法を改良した。 このMSプラットフォームはフランシスクリック研究所で開発され、シャリテー – ベルリン医科大学で31人のCOVID-19患者の血清分析に適用された。 この結果は、同じ病院でCOVID-19の追加の17人の患者と15人の健康な人々でさらに検証された。 研究者らは、彼らの発見がCOVID-19患者のこれらのタンパク質の1つまたはいくつかのレベルをチェックするための簡単なルーチンテストの開発につながることを期待している。 このような検査の結果は、医師がどのような治療を行うかを決定する際に使用できる。
主執筆者の1人であり、フランシスクリック研究所の代謝生物学研究所のポスドクであるChristoph Messner博士は、次のように述べている。「医師がCOVID-19患者が重症になるかどうかを予測するのに役立つテストは非常に貴重だ。 それは彼らが各患者のために病気を最もよく管理する方法について決定を下すのを助けるだけでなく、最も危険にさらされている患者を識別するのを助ける。 我々が特定したバイオマーカーが、これらの極めて必要なテストの開発につながることを願っている。」
チームが特定した3つの重要なタンパク質は、炎症を引き起こすタンパク質であるインターロイキン6（IL-6）と関連しており、重篤な症状の既知のマーカーだ。 研究者らは、これらの関連タンパク質を標的とする薬物を使用することにより、これらの症状のいくつかを緩和することが可能かもしれないと示唆している。
フランシスクリック研究所のグループリーダーおよびシャリテー – ベルリン医科大学の生化学部長で、Cell Systems論文の上級著者であるMarkus Ralser博士は、次のように述べている。「この研究で使用した堅牢な方法は、 疾患の進行を予測し、治療の潜在的なターゲットを見つけられる。 我々のアプローチは、現在および将来、他の疾患にも簡単に適用でき、身体への影響についてさらに理解することができる。」
フランシスクリック研究所の代謝生物学研究所の別の主執筆者で科学者でもあるVadim Demichev博士は次のように付け加えている。「我々のテクノロジープラットフォームはCOVID-19用に特別に開発されたわけではないが、この疾患に関する新しい洞察を得ることは非常に有用であることが証明されている。 近い将来、さまざまな条件の予後分析テストの開発に役立つことを願っている。」
このアプローチを実装するためのすべてのプロトコルとソフトウェアは無料で入手できる。
バイオバンクのジェネレーションスコットランド（GS）スタディ内で取得した市販の血漿および血清コントロールサンプルの生データは、データセット識別子PXD018874を含むPRIDE (Perez-Riverol et al., 2019) パートナーリポジトリを介してProteomeXchangeコンソーシアムに提出された。
GSの参加者の同意条件に従い、個人レベルのデータ（オミクスおよび表現型）へのアクセスは、GSアクセス委員会によって承認を得る必要がある。
申請は、。
DIA-NNソフトウェアスイートおよびDiaNN Rパッケージはオープンソースであり、無料でダウンロードできる。
BioQucik News:27 Proteins in Blood of COVID-19 Patients ID’d by Mass Spec Approach As Potential Biomarkers to Predict Disease Severity and Possibly Direct Different Courses of Treatment
