COVID-19 のパンデミックは依然として世界中で猛威を振るっているが、アメリカ人類遺伝学会（ASHG）のメンバーは、ウイルスがどのように広がり、人々に感染するか、感受性と重症度に大きなばらつきがある理由を理解し、そして治療の可能性を探すことに取り組んでいる。10月28日水曜日、6人の研究者がASHG 2020仮想年次総会（10月27-30日）で現在のパンデミックに関連するいくつかの最新の研究結果を発表した。この会議には、世界80か国以上から6,000人を超える登録者が参加した。 これらの登録者のうち約1,000人が、「最新のCOVID-19研究アップデート」と題されたこの特別でタイムリーなセッションに参加した。
COVID-19の症状は大きく異なり、一部の患者では無症候性、他の患者では致命的だ。ヒトの遺伝的変異の役割を解明することは、感染症への感受性、ならびに患者の症状と転帰の違いについてのより良い理解をもたらす可能性がある。 3つの研究は、ヒトの遺伝学とCOVID-19の感受性と重症度に取り組んだものである。
まず初めに、Regeneron Genetics CenterのJack Kosmicki氏らは、これまでのCOVID-19最大のトランス祖先エクソームシーケンシング研究の結果を発表した。以前の発見から、研究者は3p21.31遺伝子座を特定し、それが重症度の変動に寄与することを示唆した。このグループは、COVID-19とABO遺伝子座間の関連を再現できず、以前の発見が偽陽性であった可能性があることを示唆している。以前に報告された関連性に加えて、Kosmicki氏らは、COVID-19に関連する3つの新規遺伝子座と3つの遺伝子も特定した。
2番目のレポートでは、
フィンランド分子医学研究所のAndrea Ganna氏らが、COVID-19 Host Genetics Initiativeからのメタアナリシスを報告した。これは、人類遺伝学コミュニティを結集してCOVID-19に関連するデータを生成、共有、分析するための共同の国際的な取り組みだ。研究チームは、感受性ではなく、疾患の重症度と強く関連している染色体3上の遺伝子変異を特定した。 イニシアチブのすべての結果と同様に、これらは使用制限なしでWebサイト（https://www.covid19hg.org/）ですぐに利用できる。
イェール大学のGitaPathak氏によって提示された3番目の研究は、COVID-19によって誘発されたいくつかの生物学的メカニズムの関与を示唆している。 研究者らは、2つの染色体領域で6つのCOVID-19関連遺伝子を特定することに加えて、炎症のマーカーと一致するLDLコレステロール、コルチゾールレベル、単球数などの検査値との関連を明らかにした。
これらの3つの研究は、将来の研究のための刺激的な分野を示している。 たとえば、3つのグループすべてが3番染色体を感受性遺伝子座として特定したが、メカニズムと詳細を解明するにはさらなる研究が必要だ。
別のCOVID-19関連の研究で、国立衛生研究所の国立癌研究所のA. Rouf Banday氏は、ウイルスSARS-CoV-2が標的細胞に侵入するために使用する細胞表面酵素ACE2の新規変異体の発見を報告した。研究者らは、ACE2ではなくdACE2と呼ばれるこの変異体が、インターフェロンおよびSARS-CoV-2を含むウイルス感染によって誘導されることを示した。 調査結果は、将来の治療戦略を検討し、COVID-19の感受性と結果を理解するために重要だ。
オレゴンヘルス＆サイエンス大学のBrendan O’Connell氏らは、ウイルスゲノムの迅速な配列決定により、時間の経過とともに発生する突然変異を追跡することにより、コミュニティ内の特定の伝達鎖の識別が可能になることを実証した。 研究者らは、発生の最初の6か月間のオレゴンでのCOVID-19の導入数と拡散を決定した。 全体として、データは、オレゴンでの新しいウイルス導入の主な原因は国内旅行からであるという結論を強く支持している。
最後に、カリフォルニア大学サンフランシスコ校のTomiko Oskotsky氏は、COVID-19で新しい治療用途を持つ可能性のある既存の薬剤を特定するための、コンピューターよるドラッグリポジショニングパイプラインの適用について議論した。 これまでの結果は有望であり、検証実験では、これまでにテストされた12ヒットのうち9つがSARS-CoV-2に対して測定可能な抗ウイルス活性を持っていることが示された。
REFERENCES
Banday, A.R., et al. (Date). Abstract: The discovery of a novel primate-specific and inducible truncated isoform of ACE2 and its implications for SARS-CoV-2 infection. Presented at the American Society of Human Genetics 2020 Virtual Meeting.
Ganna, A., et al. (Date). Abstract: The COVID-19 host genetics initiative identifies genetic factors associated with COVID-19 susceptibility, severity, and outcomes. Presented at the American Society of Human Genetics 2020 Virtual Meeting.
Kosmicki, J., et al. (Date). Abstract: Trans-ancestry imputation and exome sequencing of 868,021 individuals identifies 4 loci and 3 genes associated with Covid-19 susceptibility and hospitalization. Presented at the American Society of Human Genetics 2020 Virtual Meeting.
O’Connell, B., et al. (Date). Abstract: Genomic surveillance of SARS-CoV-2 in Oregon from February-July 2020 identifies at least 25 independent introductions, transmission dynamics of a healthcare workplace superspreading event, and recurrent deletions removing ORF7a from the viral genome. Presented at the American Society of Human Genetics 2020 Virtual Meeting.
Ostotsky, T., et al. (Date). Abstract: Transcriptomics-based drug repositioning pipeline identifies therapeutic candidates for COVID-19. Presented at the American Society of Human Genetics 2020 Virtual Meeting.
Pathak, G., et al. (Date). Abstract: Integrative analyses with large-scale COVID-19 GWAS identifies susceptibility genes underlying hospitalized outcomes. Presented at the American Society of Human Genetics 2020 Virtual Meeting.
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